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四川汉族人群个常染色体基因座多态性及法医学(2)
作者:网站采编关键词:
摘要：2.2 群体遗传学参数 四川汉族19个STR基因座的群体遗传学参数见表2。其中，各基因座等位基因数量7～26个，HE为0.6170～0.9151，DP为0.7774～0.9865，MP为0.0135～
2.2 群体遗传学参数
四川汉族19个STR基因座的群体遗传学参数见表2。其中，各基因座等位基因数量7～26个，HE为0.6170～0.9151，DP为0.7774～0.9865，MP为0.0135～0.2226，PIC为0.5464～0.9108，PEtri为0.3118～0.8263，PEduo为 0.197 9～0.712 1。经 Hardy-Weinberg平衡检验，所有基因座P值均大于0.05，为0.080 7～0.983 1，各基因座基因型分布情况符合Hardy-Weinberg平衡。CDP为0.999 999 999 999 999 999 999 991，CPEtri为0.，CPEduo为0.。
2.3 13个群体间的遗传距离及系统发生树
根据四川汉族与其他12个已报道群体间[2-13]的19个STR基因座计算得到Nei’s遗传距离（表3）。表3可见，四川汉族与湖北汉族差异最小（Rst=0.0017），与先前报道的其他汉族群体[2-5，7-8，10-11，13（]0.002 0＜Rst＜0.015 4）、云南白族[6（]Rst=0.004 6）及海南黎族[12（]Rst=0.0286）遗传距离较近，与新疆维吾尔族差异最大（Rst=0.045 2）。根据四川汉族与12个群体间的遗传距离构建的系统发生树见图1。图中，新疆维吾尔族单独聚类，四川汉族与其他11个群体聚为一类。MDS分析结果显示，四川汉族与四川汉族1、湖北汉族、云南汉族、重庆汉族、上海汉族和福建汉族在MDS图上分布在图中心偏上且聚为一簇，海南黎族位于图左上象限，而新疆维吾尔族位于左下象限（图2）。在人群PCA分析图上可见新疆维吾尔族和海南黎族分布位置相对较远，四川汉族与其他10个群体相对聚集（图3）。
表2 四川汉族19个STR基因座的群体遗传学参数Tab.2 Population genetic parameters of 19 STR loci in Sichuan Han population注：HE，杂合度；MP，匹配概率；DP，个体识别率；PIC，多态信息含量；PEtri，三联体非父排除率；PEduo，二联体非父排除率。1）表示Hardy-Weinberg平衡检验。P值1）0.9505 0.7868 0.6252 0.0807 0.9713 0.8191 0.8275 0.7730 0.5100 0.3563 0.4949 0.5605 0.6101 0.6669 0.7988 0.7548 0.8235 0.9831 0.8162基因座D19S433 D5S818 D21S11 D18S51 D6S1043 D3S1358 D13S317 D7S820 D16S539 CSF1PO Penta D vWA D8S1179 TPOX Penta E TH01 D12S391 D2S1338 FGA数量16 8 18 17 20 8 10 12 8 9 1 1 9 1 1 7 2 6 9 1 4 14 18 HE 0.8160 0.7802 0.8143 0.8768 0.8743 0.7252 0.8010 0.7685 0.7777 0.7194 0.7952 0.8102 0.8526 0.6170 0.9151 0.6545 0.8460 0.8668 0.8609 MP 0.0577 0.0793 0.0532 0.0366 0.0298 0.1303 0.0705 0.0850 0.0801 0.1139 0.0629 0.0688 0.0437 0.2226 0.0135 0.1684 0.0437 0.0324 0.0341 DP 0.9423 0.9207 0.9468 0.9634 0.9702 0.8697 0.9295 0.9150 0.9199 0.8861 0.9371 0.9312 0.9563 0.7774 0.9865 0.8316 0.9563 0.9676 0.9659 PIC 0.7921 0.7502 0.7973 0.8436 0.8603 0.6715 0.7695 0.7387 0.7514 0.6862 0.7788 0.7741 0.8281 0.5464 0.9108 0.6112 0.8244 0.8523 0.8482 PEtri 0.8160 0.5628 0.6259 0.7483 0.7432 0.4684 0.6009 0.5420 0.5583 0.4589 0.5901 0.6180 0.7000 0.3118 0.8263 0.3614 0.6869 0.7282 0.7166 PEduo 0.4692 0.3987 0.4784 0.5597 0.5902 0.3025 0.4264 0.3854 0.3980 0.3203 0.4465 0.4321 0.5235 0.1979 0.7121 0.2521 0.5204 0.5748 0.5684
表3 四川汉族已报道的12个群体间19个STR基因座计算得到的Nei’s遗传距离（Rst）Tab.3 Nei’s genetic distances calculated from 19 STR loci between Sichuan Han and 12 previously reported populations注：“-”表示无数据群体四川汉族四川汉族1福建汉族山东汉族贵州汉族云南白族云南汉族重庆汉族新疆维吾尔族上海汉族湖北汉族海南黎族江苏汉族四川汉族0.0000 0.0046 0.0034 0.0154 0.0137 0.0046 0.0020 0.0031 0.0452 0.0031 0.0017 0.0286 0.0098四川汉族1[2]福建汉族[3]山东汉族[4]贵州汉族[5]云南白族[6]云南汉族[7]重庆汉族[8]新疆维吾尔族[9]上海汉族[10]湖北汉族[11]海南黎族[12]江苏汉族[13]--0.0063 0.0191 0.0173 0.0075 0.0040 0.0046 0.0461 0.0055 0.0043 0.0319 0.0156 0.0077 0.0048 0.0040 0.0471 0.0052 0.0029 0.0310 0.0161 0.0151 0.0164 0.0605 0.0151 0.0139 0.0546 0.0143 0.0146 0.0582 0.0170 0.0133 0.0404 0.0060 0.0426 0.0053 0.0045 0.0377 0.0469 0.0034 0.0019 0.0294 0.0041 0.0029 0.0305 0.0444 0.0871 0.0371
图1 13个中国群体的系统发生树Fig.1 Phylogenetic tree of 13 Chinese populations
图2 13个中国群体的MDS分析Fig.2 MDS analysis of 13 Chinese populations
图3 13个中国群体的PCA分析Fig.3 PCA analysis of 13 Chinese populations
3 讨 论
四川省位于中国西南腹地，东邻重庆，西衔西藏，北接甘肃、陕西、青海，南连云南、贵州。四川为多民族聚居地，据第六次人口普查数据，此地居住人口超过8 041万人，其中汉族人口约占94%，其余55个少数民族约490.8万人常住于此[16]。汉族和少数民族间的起源和基因的遗传多样性一直是近年来的研究热点，作为中国连接要塞的四川，明确其汉族人群的遗传多态性和邻近群体的遗传关系对准确评估涉及四川汉族人群的亲权鉴定、个体识别、数据库建设和群体遗传学探究有重要意义。
文章来源：《四川建材》 网址: http://www.scjczz.cn/qikandaodu/2021/0315/1004.html